A contínua luta entre os adultos que fizeram a iniciação e as crianças que não o fizeram teve o seu fim depois do descontrole do robô Sachumodo. Porém, ao mesmo tempo, inúmeros mistérios continuaram sem resposta… O que significam as últimas palavras que o jovem Doutor Roscoe disse? Qual a verdade envolvida entre aquele que arquitetou o mundo e criou Roscoe e Nova? Alita, depois da derradeira batalha contra Sachumodo, vai atrás de sua amiga Lou, que está na cidade espacial terrestre Jeru, bem acima da cidade aérea Zalem. Este é o início da jornada do Anjo de Combate em busca de respostas! A história atravessa a estratosfera e o palco agora é o longínquo espaço.